「廉署保密、密密實實」，不單是廉署鼓勵市民舉報貪污的宣傳口號，更是廉署一直處理貪污投訴及調查的重要原則。
就舉報貪污的程序為例，整個過程都有嚴謹的制度及措施，確保舉報人的身份及內容均絕對保密。例如接見投訴人的報案室都擁有配備完善的隔音設備，保證私隱度十足。接受市民舉報的報案室屬於限制區域，只有獲授權人士，例如當值主任才可以內進。
而當值主任，會根據嚴謹程序，聽取舉報人貪污投訴的相關資料，再寫成報告。完成之後，會即日轉交至舉報中心處理，所有舉報資料均存放至機密檔案裡，非負責人員絕對不能查閱。廉署職員亦恪守保密原則，非工作需要，絕不談論案情，故此舉報人不用擔心個人資料或者投訴資料外洩的問題。
調查期間要做足功夫保密案情，全因貪污是種很隱蔽的罪行。要進行調查，並且將貪污份子繩之於法，是件非常困難的事情。為免調查行動曝光，打草驚蛇影響搜證，任何人士，包括舉報人及廉署人員，未經授權絕對不可向其他人士披露有關貪污案件的調查內容，以及被調查人士的身份，否則就有可能觸犯《防止賄賂條例》第30條。一經定罪，可處第4級罰款及監禁1年。
過往就有人曾向受查人士通風報訊，或者因為想引起其他人注意而披露調查資料，而被廉署起訴。